H κάπαρη θεωρείται ορεκτικό και διουρητικό βότανο. Με την κάπαρη αρωματίζεται το λάδι, ξίδι ή βούτυρο, προστίθεται σε τυριά, γαρνιτούρες ή γίνονται τουρσιά και πίκλες.
Χρησιμοποιείτε κυρίως για γαρνίρισμα σε σαλάτες όπως Χωριάτικη και Ντάκος αλλά και ως καρύκευμα στην φάβα και στην μελιτζανοσαλάτα.
Μπορεί να μαγειρευτεί με ψάρι και κυρίως με παστό μπακαλιάρο.